Основным видом загрязнений хозяйственно-бытовых стоков являются органические вещества и соли аммония. Это составляет питательную среду для различных микроорганизмов. Наряду с ними присутствуют и соединения, не включаемые в рацион бактерий, но способствующие их размножению. Таковыми являются соединения фосфора.
Установки биологической очистки воспроизводят природные процессы и создают оптимальные условия для развития микроорганизмов, участвующих в переработке органики и других питательных веществ.
Для удаления фосфорных соединений применяются физико-химические способы переработки сточных вод, зачастую располагающиеся в заключительных этапах биологической очистки. Для интенсификации используются реагенты: флокулянты и коагулянты.
Всё это приводит к тому, что биоценоз водоема не получает дополнительного питания из поступающих очищенных сточных вод, уменьшает эвтрофикацию водоема и не позволяет в большом количестве увеличиваться флоре и фауне и тем самым снижает биогенную нагрузку на водоемы.